هرمافرودیت (به انگلیسی: Hermaphrodite) به گونه هایی از جانداران گفته می‌شود که هر دو اندام جنسی نر و ماده را دارا باشند.

این ویژگی ممکن است ناشی از بیماری بوده و یا وضعیت طبیعی یک گونه محسوب شود.

شته ها، حلزون ها و کرم‌های خاکی از نمونه های شناخته شده گونه های هرمافرودیت هستند.

ریشه نام گذاری هرمافرودیت به یکی از اسطوره های یونان باستان به نام هرمافرودیته بازمی‌گردد که ویژگی های زنان و مردان را همزمان داشته است (سالماسیس، او را در آغوش گرفته بود و از خدایان خواسته بود که آنها با هم یکی شوند).